O parque industrial da Usina São Francisco está instalado em local privilegiado, entre florestas, canaviais e vegetação ribeirinha exuberante. O processamento industrial adota as mais modernas técnicas de produção, com foco em produtividade, minimização de impactos ambientais e segurança do trabalhador.

A cana orgânica chega à unidade de processamento minutos após a colheita, o que preserva integralmente suas características naturais. A pesagem das cargas inicia um processo documental que permite a perfeita rastreabilidade da produção.

No laboratório de qualidade, analisam-se amostras da cana orgânica. Posteriormente, ela é descarregada na mesa de alimentação, que a levará ao sistema de preparo, onde será desintegrada. Extrai-se o caldo orgânico por meio de um processo mecânico de moagem. Como resultado da moagem de cana crua, obtém-se um caldo de alta pureza e cor incomparável. Após a moagem, o caldo é filtrado e enviado para a fábrica de açúcar.

Deposita-se o caldo orgânico em tanques, nos quais as impurezas minerais e vegetais decantam. Essas impurezas passam por filtros a vácuo, originando um importante fertilizante orgânico, que retorna aos canaviais. O caldo limpo é submetido a um processo de múltipla evaporação, resultando num xarope orgânico com alta concentração de sacarose, enviado aos cristalizadores a vácuo, onde são formados os cristais de sacarose. O produto final da cristalização compõe-se de cristais de sacarose e melaço.

Por meio de centrifugação, separa-se o açúcar do melaço este segue como matéria-prima para a produção do álcool. O açúcar orgânico é seco e empacotado em embalagens que atendem padrões de fabricação e que podem ser recicladas após o consumo. Estocado em armazéns especialmente reservados para produtos orgânicos, pode ser expedido em contêineres para transporte marítimo, no caso das exportações, ou em outros veículos de carga, conforme a necessidade do cliente.

Monitora-se continuamente o processo industrial, ao longo da cadeia de produção. A Usina São Francisco possui um laboratório de qualidade, no qual ocorrem análises de caldo, bagaço, melaço, açúcar e álcool, entre outros. No caso do açúcar, os parâmetros de qualidade estabelecidos pela especificação são analisados regularmente, emitindo-se um certificado de qualidade ao fim da produção de cada lote.